Союз не был лишен споров. Россия чувствовала, что поскольку полная интеграция может дорого им обойтись, они решили переориентировать свой союз на достижение двух целей: во-первых, снижение экономического бремени, которое несет Беларусь, и во-вторых, взять под контроль инфраструктуру транзита энергоресурсов в Беларуси. Это привело к многочисленным конфликтам и газовым войнам между двумя странами. Когда возник украинский кризис, Россия аннексировала регион Крым в 2014 году. Это подтолкнуло Лукашенко к тому, чтобы вновь утвердить белорусскую идентичность. Он произнес речь “Мы не русские, мы белорусы”, и это тоже на белорусском языке. Происходили торговые споры и пограничные споры, которые ослабляли отношения между двумя странами.
Несмотря на дипломатическую напряженность, они сохранили крепкие военные связи и сотрудничали в совместных военно-научных предприятиях. По состоянию на 2017 год отношения между Россией и Беларусью улучшились после проведения многочисленных военных учений.
1.3 Политические предпосылки образования Союзного государства